在播磨，武藏一行遇见了上杉龙臣统领的大型武士团——上杉武士团。他们的目的是讨伐盘踞在淡路岛的巨大鬼神“炮战龙八岐大蛇”。在那里，还有武田尚虎率领的武田武士团，与武藏同龄的武士岛津秋弘、尼子胜巳，以及稍显不通世俗的腼腆公主猿渡满等人。 在各种想法翻涌的涡旋之中，武藏一行也加入了灭鬼的战斗。而他们要挑战的八岐大蛇，则是号称“从未被人伤及分毫”、铜墙铁壁般的鬼神。武藏和同伴们将要面对的，是一场前所未有的激战。
正体不明の怪獣たちが突如出現。 シュールな世界観の中で“怖カワイイ”愛玩怪獣たちが次々と登場し、縦横無尽に暴れ回る。 玩具のような外見の彼らは、見た目も行動もそのすべてが人間の想定外。 人類に未来はあるのか、ないのか？
在美丽的蔬果村里，各式各样的蔬菜和水果们幸福快乐地生活在那里，有柠檬太太、小柠檬、苹果老师、青蛙大夫、香蕉夫妇、胡萝卜警长、胡桃太太、南瓜先生、固执的胡桃刚克爷爷和和蔼的贝洛林村长等村民。而我们的主角就是聪明可爱的三人组，洋葱汤培、核桃柯露克和小花生佩可。 然而蔬果村的宁静却被大坏蛋黑蝙蝠、老鼠塔丘和鼹鼠毛毛一伙的到来而打破。黑蝙蝠和他的团伙们不断的盗取村子里的财物和食物，成为人人痛恨的大坏蛋。洋葱汤培、核桃柯露克和小花生佩可团结其他蔬果村的村民，勇敢地与黑蝙蝠和他的同伙们对抗。最终他们用团结、友爱和宽容，感化了黑蝙蝠一伙。蔬果村又恢复了往日的平静与祥和。
C.E.70年2月，地球联合军与ZAFT之间的武装冲突由于“染血的情人节”悲剧而全面升级为地球圈规模的战争。C.E.71年6月，在“非我即敌”的观念驱使下，地球联合军悍然发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。当战斗进行到最激烈的时候，少年真飞鸟失去了父母和妹妹。唯一的遗物就只有妹妹掉落的手机。获救之后，背负着家仇的真黯然离开了故土奥布前往PLANT。两年后，他成为了ZAFT的战士......
中学理科老师矢的猛（长谷川初范 饰）是一名心中充满了正义感和责任感的有志之士，对于曾经四处作恶搅得人心惶惶的怪兽，矢的猛深信其实是来自于人类的负能量造就了它们，因此，作为一名老师，矢的猛一直都致力于教导学生们什么是正义，什么是邪恶。 可是，矢的猛的一己之力实在微薄，怪兽克莱圣特重现人间，给地球带来了重大危机，UGM得知此事，派出了爱迪奥特曼来到地球惩奸除恶。在大山一树（中山仁 饰）和伊藤顺吉（大门正明 饰）的邀请之下，矢的猛加入了他们的队伍，展开了和克莱圣特的殊死搏斗。面对格外强大的敌人，矢的猛是否能够凭借自己的智慧和勇气，获得最终的胜利，保卫地球的和平呢？
南光太郎和秋月信彦在一个日食的日子出生、并且以兄弟的身份被扶养长大。信彦的父亲，秋月总一郎是秘密组织戈鲁戈姆的成员之一。在光太郎和信彦19岁生日那天，两人被这个秘密组织捉去改造成为戈鲁戈姆的支配者·创世王的候补者·世纪王。世纪王·黑日必须和世纪王·影月进行赌上性命的战斗，胜者就可以成为新一任的世纪王。但是被改造成为黑日的光太郎在秋月总一郎的帮助下，成功在脑改造手术前逃脱出来。此后光太郎成为假面骑士Black，为了保护日本，救出信彦而与戈鲁戈姆对抗。但是信彦却在被救出之前就变成世纪王·影月，于是光太郎不得不与他唯一的亲友信彦进行宿命的战斗。
正邪不能两立，光明与黑暗永远敌对。远古时期，正义的魔弹战士们为了世界的和平，早已开始和邪恶的魔物对抗，在双方实力平分秋色之下，魔弹战士失去了能量，而魔物的大魔王幽缘魔魂则化成原始的卵。那个邪恶的卵经过了几个世纪仍旧孕酿着复仇的杀机，新一代的魔弹战士将继承先人的遗志，继续为人类的和平奋斗。
安冈紫音（川澄绫子 配音）有着非常悲惨的童年，双亲惨遭凶手杀害，而年幼的她则成为了唯一的目击证人。因为受到过度的惊吓，紫音失去了说话的能力变成了哑女，住在隔壁的将棋职业棋手安冈信次无法对无家可归的紫音置之不顾，于是收留了她。就这样，紫音来到了安冈家，开始接受将棋训练。 出生于富贵之家的千金大小姐二阶堂纱织（水野理纱 配音）、男扮女装的斋藤步（朴璐美 配音）、温柔善良的久谷彻，在学习将棋的道路上，紫音结识了这些值得信赖的伙伴们。与此同时，紫音也从未放弃过追踪父母死亡的真相，她发誓要将双手沾满鲜血的凶手捉拿归案。
在本作舞台的2030年代世界中，被称为“西欧财阀”的巨大组织利用财力、武力进行世界规模的彻底性资源管理，所以技术以及人类的进步正停滞不前。因此表面上技术从2000年代起就没有改变。 此作的世界观与TYPE-MOON多作共通的世界观基本设定一致，但却是从TYPE-MOON多作共通世界观的1970年代派生出来的平行世界，而并不单纯是月姬和Fate等作品的未来。 在这个世界中大源的魔力(Mana)已经枯竭了。因此TYPE-MOON多作共通的世界观中的“魔术(Magi)”和“魔术师(Magus)”几乎都衰落了，魔术协会也只余下本来就不太依赖魔力的“阿特拉斯院”。
